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別問蛋白有多少,掌握定量方法再來說

發(fā)表時間:2023-02-27 訪問次數(shù):386

蛋白定量

蛋白定量即蛋白質(zhì)定量,蛋白質(zhì)定量根據(jù)其目的分為蛋白質(zhì)的“總定量”和特定蛋白質(zhì)的“個別定量”。蛋白定量是生物學(xué)實驗不可缺少的一部分,為驗證細胞裂解是否成功,或為了將多個樣品進行平行實驗比較或標(biāo)準(zhǔn)化保存,需對細胞裂解液進行蛋白定量;為了判定蛋白的產(chǎn)量,需對純化好的蛋白進行定量;為了將純化好的蛋白用生物素或報告酶進行標(biāo)記,同樣需要首先對蛋白樣品進行定量,以保證標(biāo)記反應(yīng)在適當(dāng)?shù)幕瘜W(xué)濃度下進行。

 

蛋白質(zhì)是一種十分重要的生物大分子,它種類繁多,結(jié)構(gòu)不一,功能各異,分子量相差很大,因此建立一個理想而又通用的蛋白質(zhì)定量分析方法很因難。

現(xiàn)測定蛋白質(zhì)含量的方法有很多:根據(jù)物理性質(zhì)來分有紫外分光光度法;根據(jù)化學(xué)性質(zhì)來分有凱氏定氮法、雙縮脲法、Folin-酚試劑法(Lowary法)、BCA法和膠體金法;根據(jù)染色性質(zhì)有考馬斯亮藍染色法、銀染法;根據(jù)其他性質(zhì)有熒光法;其中較為常見的有以下五種。

 

1

紫外分光光度法

 

蛋白質(zhì)分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸、色氨酸等芳香族氨基酸具有吸收紫外光的性質(zhì),其吸收高峰在280 nm波長處,且在此波長內(nèi)吸收峰的光密度值與蛋白濃度成正比,故可作為蛋白質(zhì)定量測定的依據(jù)。該方法是最快的蛋白質(zhì)定量方法,但由于各種蛋白質(zhì)中酪氨酸和色氨酸含量不同,如要準(zhǔn)確定量則應(yīng)有待測蛋白質(zhì)的純品作為標(biāo)準(zhǔn)來比較,或者知道其消光系數(shù)作為參考。另外,不少雜質(zhì)在280 nm波長下也有—定吸收能力,可能發(fā)生干擾,其中核酸(嘌呤和嘧啶)的影響尤為嚴重。核酸的最大吸收峰是在260 nm,因此若溶液中存在核酸,必須同時測定OD260與OD280然后根據(jù)兩種波長的吸收度比值,通過經(jīng)驗公式校正,以消除核酸的影響而推算出蛋白質(zhì)的真實含量。 

優(yōu)

操作簡便迅速,且不消耗樣品(可以回收),多用于純化蛋白質(zhì)的微量測定。

(1)當(dāng)待測的蛋白質(zhì)與標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)中的酪氨酸和色氨酸含量差異較大時,會產(chǎn)生—定誤差。

(2)混有核酸時必須分別測定280 nm和260 nm兩處的OD值,再按公式推算蛋白質(zhì)含量。

 

2

雙縮脲法

 

雙縮脲(NH3CONHCONH3)是兩個分子脲經(jīng)180℃左右加熱放出一個分子氨后得到的產(chǎn)物。在強堿性溶液中,雙縮脲與CuSO4形成紫色絡(luò)合物,稱為雙縮脲反應(yīng)。凡具有兩個酰胺基或兩個直接連接的肽鍵,或能通過一個中間碳原子相連的肽鍵,這類化合物都有雙縮脲反應(yīng)。紫色絡(luò)合物顏色的深淺與蛋白質(zhì)濃度成正比,而與蛋白質(zhì)分子量及氨基酸成分無關(guān),故可用來測定蛋白質(zhì)含量。測定范圍為1-10 mg蛋白質(zhì)。干擾這一測定的物質(zhì)主要有硫酸銨、Tris緩沖液和某些氨基酸等。

優(yōu)

較快速 ,不同的蛋白質(zhì)產(chǎn)生顏色的深淺相近,以及干擾物質(zhì)少。

靈敏度差,常用于需要快速但并不需要十分精確的蛋白質(zhì)測定。

3

考馬斯(Comessie)亮蘭結(jié)合法

 

考馬斯亮蘭結(jié)合法是近年來發(fā)展起來的蛋白質(zhì)定量測定法。考馬斯亮蘭能與蛋白質(zhì)的疏水區(qū)相結(jié)合,這種結(jié)合具有高敏感性,考馬斯亮蘭G250 的最大光吸收峰在465 nm,當(dāng)它與蛋白質(zhì)結(jié)合形成復(fù)合物時,其最大吸收峰變?yōu)?95 nm。在一定范圍內(nèi),考馬斯亮蘭G250-蛋白質(zhì)復(fù)合物呈青色。在595 nm下,光密度與蛋白質(zhì)含量呈線性關(guān)系。故可以用于蛋白質(zhì)含量的測定。

優(yōu)

(1)操作簡便、快速;檢測靈敏;重復(fù)性好。 

(2)顯色迅速,約2分鐘內(nèi)可完成染料與蛋白質(zhì)的結(jié)合,所現(xiàn)顏色至少在1小時內(nèi)是穩(wěn)定的。 

(3)與改良Lowary法相比,干擾物質(zhì)較少。 

(1)當(dāng)樣品中存在較大量的SDS、TritonX-100等去垢劑時,顯色反應(yīng)會受到干擾。如樣品緩沖液呈強堿性時也會影響顯色,故必須預(yù)先處理樣品。 

(2)考馬斯亮蘭G250染液不宜久存,以1-2月為宜。 

4

Lowary蛋白定量法

 

 

Lowary法是雙縮脲法和福林酚法的結(jié)合與發(fā)展,其原理是:蛋白質(zhì)溶液用堿性銅溶液處理,形成銅-蛋白質(zhì)的絡(luò)合鹽,在加入酚試劑后,除使肽鏈中酪氨酸、色氨酸和半胱氨酸等顯色外,還使雙縮脲法中肽鍵、堿性銅的顯色效果更強烈。因此,Lowary法的顯色效果比單獨使用酚試劑強烈3-15倍,為雙縮脲法的100倍。由于肽鍵顯色效果增強,從而減小了因蛋白質(zhì)種類引起的偏差。 

注意事項

(1)酚試劑只在酸性條件穩(wěn)定,故當(dāng)其加到堿性的銅-蛋白質(zhì)溶液中時,必須立即混勻,以便在磷鉬酸-磷鎢酸試劑被破壞前,還原反應(yīng)即能發(fā)生。 

(2)為了保證反應(yīng)進行完全,反應(yīng)在25~30℃水浴中進行,反應(yīng)30 min后準(zhǔn)時比色。 

(3)避免還原物質(zhì)干擾本實驗。 

優(yōu)

微克級高靈敏度定量測定,穩(wěn)定。

(1)受植物體內(nèi)存在的酚類物質(zhì)干擾。

(2)去污劑如TritonX-100,SDS,NP-40的濃度超過0.2%時會影響定量結(jié)果。

 

5

BCA法

BCA( Bicinchoninic acid)法是近來廣為應(yīng)用的蛋白定量方法。其原理與Lowary法蛋白定量相似,即在堿性環(huán)境下蛋白質(zhì)與Cu2+絡(luò)合并將Cu2+還原成Cu1+。BCA與Cu1+結(jié)合形成穩(wěn)定的紫藍色復(fù)合物,在562 nm處有高的光吸收值并與蛋白質(zhì)濃度成正比,據(jù)此可測定蛋白質(zhì)濃度。

BCA蛋白定量法需要兩種試劑:

試劑A:稱取1 g sodium bicinchoninate,2 g Na2CO3,0.16 g酒石酸鈉,0.4 g NaOH和0.95 g NaHCO3,定容到100 ml,用NaOH將pH調(diào)到11.25。

試劑B:將0.4 g CuSO4•5H2O溶于10 ml水中。

工作液:100份試劑A和2份試劑B混合。

測量方法:取25 μl 標(biāo)準(zhǔn)品加入到200 μl BCA工作液中,37℃或60 ℃孵育30 min,檢測562 nm處的吸光度繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。用同樣的方法檢測蛋白樣品的吸光度可算出蛋白樣品的濃度。

 

優(yōu)

(1)靈敏度高,檢測濃度下限達到25 μg/ml,最小檢測蛋白量達到0.5 μg,待測樣品體積為1-20 μl。

(2)操作簡單,快速,45分鐘內(nèi)完成測定,比經(jīng)典的Lowary法快4倍且更加方便。

(3)測定蛋白濃度不受絕大部分樣品中的去污劑等化學(xué)物質(zhì)的影響,可以兼容樣品中高達5%的SDS,5%的Triton X-100,5%的Tween 20,60,80。

(4)在20-200 μg/ml濃度范圍內(nèi)有良好的線性關(guān)系。

(5)檢測不同蛋白質(zhì)分子的變異系數(shù)遠小于考馬斯亮藍蛋白定量法。

(6)經(jīng)濟實用,除試管外,測定可在微板孔中進行,大大節(jié)約樣品和試劑用量。

受螯合劑和略高濃度的還原劑(EDTA小于10 mM,DTT小于1 mM,巰基乙醇低于1mM)的影響。

 


以上是針對全蛋白質(zhì)的“總定量法”,然而許多實驗需要對溶液中特定蛋白進行定量分析,即針對特定蛋白質(zhì)的“個別定量”。針對特定蛋白定量常用的方法有酶聯(lián)免疫吸附試驗法(ELISA),免疫印跡分析法(WB)和質(zhì)譜檢測(MS)。


 

1

ELISA

 

 

ELISA是溶液中特定蛋白定量的一種常用方法,通常是在96孔板上進行,關(guān)鍵步驟是特定抗原/蛋白的固定。具體來說,ELISA有不同變種。

直接或間接ELISA

特定抗原/蛋白直接吸附到檢測板,封閉未被抗原包被的孔板表面,然后在孔板中加入酶標(biāo)(直接ELISA)或未酶標(biāo)(間接ELISA)的第一抗體,在測試孔板中,一抗與抗原/蛋白相結(jié)合。對于未酶標(biāo)的第一抗體,加入酶標(biāo)的第二抗體與第一抗體結(jié)合。最后,加入酶底物(通常是四甲基聯(lián)苯胺TMB或堿性磷酸酶ALP)使溶液發(fā)生顏色變化然后使用分光光度計檢測。顏色變化與蛋白質(zhì)濃度是直接相關(guān)的。

直接ELISA的優(yōu)點是速度快,并且沒有第二抗體的交叉反應(yīng)問題,但局限是第一抗體的標(biāo)記可能是費時和昂貴的。此外,信號放大是最弱的。因此,更常用的是

夾心ELISA

特定抗原/蛋白結(jié)合在孔板表面包被的第一抗體(捕獲抗體)和酶標(biāo)的第二抗體(檢測抗體)之間,第二抗體比較容易買到,但可能會發(fā)生第二抗體的交叉反應(yīng)。

任何ELISA測定蛋白質(zhì)濃度的一個重要環(huán)節(jié)都是蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)曲線,通常是連續(xù)稀釋已知濃度的蛋白質(zhì),從而繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。

2

WB

 

WB只能半定量。通過凝膠電泳把原始或變性的蛋白質(zhì)分開,把蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)膜(硝酸纖維素或PVDF),然后使用特定的酶標(biāo)抗體檢測。最后,加入適當(dāng)?shù)牡孜铮ɑ瘜W(xué)發(fā)光底物)產(chǎn)生可檢測的信號。雖然WB比ELISA更費時,但是WB不僅可以對特定的蛋白進行定量,而且可以在實驗中同時檢測蛋白質(zhì)修飾。

3

MS

 

MS是蛋白質(zhì)定量的新興方法。在蛋白質(zhì)組學(xué)分析中,除了蛋白定性之外,一個重要的步驟就是對特定的蛋白進行定量分析。MS定量蛋白的方法有很多。

  • 常用的方法是較重的穩(wěn)定同位素碳(13C)或氮(15N)加入到第一個樣本(多肽或蛋白質(zhì)),而相應(yīng)的輕同位素(12C和14N)加入到第二個樣本(內(nèi)標(biāo)),然后混合這兩個樣本進行分析。由于兩個樣本的質(zhì)量差,用質(zhì)譜分析儀測定的兩個樣本峰強度的比值就相當(dāng)于其相對豐度比。

  • 質(zhì)譜蛋白定量的第二種方法,可以不用標(biāo)記樣本,即用基質(zhì)輔助激光解吸/電離 - MALDI分析。

使用質(zhì)譜這種通用方法可以在一次實驗中同時進行定量和定性檢測。但這種方法需要的檢測儀器很昂貴,從而限制了該方法的使用。

 

總之,雖然測定蛋白質(zhì)含量的方法很多,但還沒有一個完美的方法。在選擇測定方法時,可根據(jù)實驗要求和實驗室條件決定。